青年学者论坛-浅谈染色质高级结构在转录调控中的作用

报告题目：浅谈染色质高级结构在转录调控中的作用

报告时间：2023年4月14日 14：15

主讲人：宋晓元 教授

主持人：王光辉 教授

地点：云轩楼2108会议室

专家简介

宋晓元，中国科学技术大学生命科学学院教授，博士生导师，曾获国家级青年人才项目。本科和硕士毕业于北京师范大学王永潮教授实验室，博士毕业于美国罗彻斯特大学Martin A. Gorovsky教授实验室，在美国加州大学圣地亚哥分校医学院/HHMI Michael G. Rosenfeld教授实验室进行博士后训练。

长期研究由长链非编码RNA (lncRNA) 和三维基因组空间结构所组成的三维空间转录调控在脑衰老以及精子发生等过程中的作用。提出了lncRNA介导染色质相互作用构成转录的三维空间调控模型（Protein Cell 2015），并在脑衰老、精子发生等生物学过程中进行验证。揭示了哺乳动物小鼠精子发生过程中三维基因组结构的动态变化（iScience 2020）和单细胞模式动物四膜虫大、小核不同的三维基因组结构并发现了大核染色体形成的可能机制（Genome Research 2020）；开发了可以高效地同时检测染色质开放性和三维空间基因组结构的NicE-C技术（Genome Research 2022）；揭示了lncRNA Synage在小脑突触结构和功能中的作用及机制（Cell Death Differentiation 2021）；发现了lncRNA Malat1 3’区转录本抑制小鼠视网膜氧化应激的生理学功能（iScience 2023）；合作发现了保守的lncRNA簇（CNIB1）在发育和视觉中的功能和机制（Nucleic Acids Research 2019）。

代表性文章

1. Luo Z.#, Zhang R.#, Hu T.#, Zhu Y., Wu Y., Li W., Zhang Z., Yao X., Liang H., Song X.*. NicE-C efficiently reveals open chromatin-associated chromosome interactions at high resolution. Genome Research. 2022, 32(3):534-544.

2. Wang F.#, Wang Q.#, Liu B.#, Mei L., Ma S., Wang S., Wang R., Zhang Y., Niu C., Xiong Z., Zheng Y., Zhang Z., Shi J., Song X.*. The long noncoding RNA Synage regulates synapse stability and neuronal function in the cerebellum. Cell Death & Differentiation. 2021, 28(9):2634-2650.

3. Luo Z.#, Hu T.#, Jiang H., Wang R., Xu Q., Zhang S., Cao J., Song X.*. Rearrangement of macronucleus chromosomes correspond to TAD-like structures of micronucleus chromosomes in Tetrahymena thermophila. Genome Research. 2020, 30(3): 406-414.

4. Luo Z.#, Wang X.#, Jiang H.#, Wang R.#, Chen J., Chen Y., Xu Q., Cao J., Gong X., Wu J., Yang Y., Li W., Han C., Cheng YC., Rosenfeld MG., Sun F.*, Song X.*. Reorganized 3D genome structures support transcriptional regulation in mouse spermatogenesis. iScience. 2020, 23(4): 101034.

5. Cao J., Luo Z., Cheng Q., Xu Q., Zhang Y., Wang F., Wu Y., Song X.*. Three-dimensional regulation of transcription. Protein & Cell. 2015, 6(4):241-53.